Die Mutterpfarre der Seelsorgeeinheit Wersten-Himmelgeist ist St. Nikolaus in Himmelgeist, das schon im Jahr 904 urkundlich erwähnt wurde. Der heutige Stadtteil Wersten bestand bis zum Beginn des 19. Jahrhunderts nur aus wenigen Höfen, die zu Himmelgeist gehörten. Im 19. Jahrhundert wuchs die Bevölkerung jedoch ständig, so dass bald der Wunsch nach einer eigenen Pfarrgemeinde für Wersten aufkam. 1893 wurde eine alte Kesselschmiede als erste Notkirche für Wersten geweiht. 1894 wurde der erste Seelsorger für die Kapellengemeinde ernannt, die am 22.03.1901 zur selbständigen Pfarre „St. Maria Rosenkranz“ erhoben wurde. Bis etwa 1970 wuchs die Zahl der Pfarrangehörigen weiter. Deshalb wurde 1959 die „Bende“ (westlich der Kölner Landstraße) als selbständige Pfarre „St. Maria in den Benden“ abgetrennt.

Seit 1984 bildet die Pfarrgemeinde St. Maria Rosenkranz mit der „Tochterpfarre“ St. Maria in den Benden und seit 1992 auch mit der „Mutterpfarre“ St. Nikolaus eine Seelsorgeeinheit mit einem gemeinsamen Pfarrer und gemeinsamen hauptamtlichen Seelsorgerinnen und Seelsorgern. Das hat große Auswirkungen auf das Gemeindeleben, da immer auch der größere Bereich im Blick ist. Viele Aktivitäten lassen sich leichter für die ganze Seelsorgeeinheit durchführen. Zugleich bemühen wir uns aber auch, das Eigenleben und die örtlichen Traditionen der einzelnen Pfarrgemeinden zu fördern und zu entfalten. Im Jahr 2001 haben sich die Pfarrgemeinderäte und Kirchenvorstände für das Kooperationsmodell „Pfarreiengemeinschaft“ entschieden. Seitdem gibt es deshalb für unsere Seelsorgeeinheit einen gemeinsamen Pfarrgemeinderat mit Pfarrausschüssen für die einzelnen Gemeinden. Die Kirchenvorstände bleiben getrennt, haben aber für die gemeinsamen Aufgaben einen Kirchengemeindeverband als Rechtsträger für die Seelsorgeeinheit gebildet, der im Januar 2003 errichtet wurde.

Seit dem 01.01.2008 gehören wir - nach Weisung des Erzbistums - zusammen mit den Gemeinden von Holthausen und Itter zu einem gemeinsamen Seelsorgebereich. Hierfür wurde Pfarrer Frank Heidkamp zum "leitenden Pfarrer" ernannt und hat alle Aufgaben und Verantwortungen für die fünf Gemeinden übernehmen. Pfarrer Hubert Clement steht als "Pfarrvikar" stärker für die Seelsorge zur Verfügung. Seit November 2009 hat die Seelsorgeeinheit einen gemeinsamen Pfarrgemeinderat.